Protein–RNA interactions for Protein: O60565

GREM1, Gremlin-1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREM1O60565 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GREM1O60565 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GREM1O60565 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GREM1O60565 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GREM1O60565 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GREM1O60565 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GREM1O60565 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GREM1O60565 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GREM1O60565 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GREM1O60565 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GREM1O60565 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GREM1O60565 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GREM1O60565 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GREM1O60565 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GREM1O60565 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GREM1O60565 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GREM1O60565 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GREM1O60565 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GREM1O60565 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GREM1O60565 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GREM1O60565 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GREM1O60565 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GREM1O60565 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GREM1O60565 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GREM1O60565 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GREM1O60565 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GREM1O60565 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GREM1O60565 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GREM1O60565 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GREM1O60565 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GREM1O60565 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GREM1O60565 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GREM1O60565 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GREM1O60565 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GREM1O60565 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GREM1O60565 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GREM1O60565 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GREM1O60565 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GREM1O60565 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GREM1O60565 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GREM1O60565 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GREM1O60565 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GREM1O60565 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GREM1O60565 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GREM1O60565 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GREM1O60565 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GREM1O60565 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GREM1O60565 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GREM1O60565 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GREM1O60565 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GREM1O60565 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GREM1O60565 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GREM1O60565 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GREM1O60565 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GREM1O60565 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GREM1O60565 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GREM1O60565 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GREM1O60565 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GREM1O60565 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GREM1O60565 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GREM1O60565 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GREM1O60565 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GREM1O60565 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GREM1O60565 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GREM1O60565 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GREM1O60565 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GREM1O60565 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GREM1O60565 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GREM1O60565 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GREM1O60565 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GREM1O60565 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GREM1O60565 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GREM1O60565 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GREM1O60565 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GREM1O60565 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GREM1O60565 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GREM1O60565 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GREM1O60565 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GREM1O60565 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GREM1O60565 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GREM1O60565 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GREM1O60565 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GREM1O60565 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GREM1O60565 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GREM1O60565 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GREM1O60565 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GREM1O60565 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GREM1O60565 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GREM1O60565 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GREM1O60565 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GREM1O60565 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GREM1O60565 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GREM1O60565 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GREM1O60565 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GREM1O60565 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GREM1O60565 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GREM1O60565 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GREM1O60565 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GREM1O60565 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GREM1O60565 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms