Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SORBS3O60504 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SORBS3O60504 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SORBS3O60504 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SORBS3O60504 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SORBS3O60504 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SORBS3O60504 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SORBS3O60504 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SORBS3O60504 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SORBS3O60504 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SORBS3O60504 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SORBS3O60504 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SORBS3O60504 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SORBS3O60504 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SORBS3O60504 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SORBS3O60504 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SORBS3O60504 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SORBS3O60504 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SORBS3O60504 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SORBS3O60504 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SORBS3O60504 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SORBS3O60504 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SORBS3O60504 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SORBS3O60504 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SORBS3O60504 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SORBS3O60504 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SORBS3O60504 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SORBS3O60504 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SORBS3O60504 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SORBS3O60504 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SORBS3O60504 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SORBS3O60504 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SORBS3O60504 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SORBS3O60504 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SORBS3O60504 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SORBS3O60504 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SORBS3O60504 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SORBS3O60504 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SORBS3O60504 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SORBS3O60504 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SORBS3O60504 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SORBS3O60504 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SORBS3O60504 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SORBS3O60504 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SORBS3O60504 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SORBS3O60504 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SORBS3O60504 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SORBS3O60504 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SORBS3O60504 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SORBS3O60504 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SORBS3O60504 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SORBS3O60504 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SORBS3O60504 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SORBS3O60504 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SORBS3O60504 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SORBS3O60504 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SORBS3O60504 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SORBS3O60504 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SORBS3O60504 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SORBS3O60504 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SORBS3O60504 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SORBS3O60504 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SORBS3O60504 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SORBS3O60504 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SORBS3O60504 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SORBS3O60504 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SORBS3O60504 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SORBS3O60504 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SORBS3O60504 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SORBS3O60504 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SORBS3O60504 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SORBS3O60504 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SORBS3O60504 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SORBS3O60504 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SORBS3O60504 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SORBS3O60504 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SORBS3O60504 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SORBS3O60504 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms