Protein–RNA interactions for Protein: O60499

STX10, Syntaxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX10O60499 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
STX10O60499 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
STX10O60499 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
STX10O60499 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STX10O60499 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STX10O60499 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
STX10O60499 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
STX10O60499 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
STX10O60499 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
STX10O60499 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
STX10O60499 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
STX10O60499 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
STX10O60499 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
STX10O60499 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
STX10O60499 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
STX10O60499 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
STX10O60499 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
STX10O60499 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
STX10O60499 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
STX10O60499 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
STX10O60499 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
STX10O60499 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
STX10O60499 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
STX10O60499 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
STX10O60499 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
STX10O60499 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STX10O60499 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STX10O60499 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STX10O60499 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STX10O60499 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STX10O60499 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STX10O60499 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
STX10O60499 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STX10O60499 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STX10O60499 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STX10O60499 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STX10O60499 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STX10O60499 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
STX10O60499 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STX10O60499 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STX10O60499 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STX10O60499 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STX10O60499 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
STX10O60499 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STX10O60499 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STX10O60499 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STX10O60499 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
STX10O60499 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STX10O60499 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STX10O60499 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STX10O60499 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
STX10O60499 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
STX10O60499 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STX10O60499 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
STX10O60499 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STX10O60499 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
STX10O60499 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STX10O60499 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STX10O60499 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
STX10O60499 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STX10O60499 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
STX10O60499 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STX10O60499 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
STX10O60499 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
STX10O60499 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STX10O60499 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
STX10O60499 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STX10O60499 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STX10O60499 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STX10O60499 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STX10O60499 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STX10O60499 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STX10O60499 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STX10O60499 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STX10O60499 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STX10O60499 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STX10O60499 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STX10O60499 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STX10O60499 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
STX10O60499 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STX10O60499 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STX10O60499 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STX10O60499 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STX10O60499 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STX10O60499 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STX10O60499 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STX10O60499 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STX10O60499 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STX10O60499 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STX10O60499 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STX10O60499 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STX10O60499 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STX10O60499 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STX10O60499 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
STX10O60499 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STX10O60499 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STX10O60499 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
STX10O60499 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
STX10O60499 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29■■■□□ 2.23
STX10O60499 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms