Protein–RNA interactions for Protein: O60232

SSSCA1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSSCA1O60232 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSSCA1O60232 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSSCA1O60232 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSSCA1O60232 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSSCA1O60232 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSSCA1O60232 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSSCA1O60232 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSSCA1O60232 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSSCA1O60232 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSSCA1O60232 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSSCA1O60232 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSSCA1O60232 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSSCA1O60232 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSSCA1O60232 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSSCA1O60232 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSSCA1O60232 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSSCA1O60232 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSSCA1O60232 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSSCA1O60232 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSSCA1O60232 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SSSCA1O60232 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSSCA1O60232 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSSCA1O60232 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSSCA1O60232 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSSCA1O60232 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSSCA1O60232 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSSCA1O60232 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSSCA1O60232 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSSCA1O60232 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSSCA1O60232 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSSCA1O60232 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSSCA1O60232 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSSCA1O60232 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSSCA1O60232 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSSCA1O60232 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSSCA1O60232 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSSCA1O60232 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSSCA1O60232 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSSCA1O60232 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSSCA1O60232 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSSCA1O60232 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSSCA1O60232 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSSCA1O60232 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSSCA1O60232 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSSCA1O60232 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSSCA1O60232 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSSCA1O60232 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSSCA1O60232 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSSCA1O60232 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSSCA1O60232 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSSCA1O60232 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SSSCA1O60232 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSSCA1O60232 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSSCA1O60232 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSSCA1O60232 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSSCA1O60232 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSSCA1O60232 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSSCA1O60232 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSSCA1O60232 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSSCA1O60232 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSSCA1O60232 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSSCA1O60232 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSSCA1O60232 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSSCA1O60232 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSSCA1O60232 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSSCA1O60232 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSSCA1O60232 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSSCA1O60232 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSSCA1O60232 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSSCA1O60232 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSSCA1O60232 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSSCA1O60232 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSSCA1O60232 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSSCA1O60232 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSSCA1O60232 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSSCA1O60232 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSSCA1O60232 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSSCA1O60232 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSSCA1O60232 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSSCA1O60232 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSSCA1O60232 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSSCA1O60232 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSSCA1O60232 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSSCA1O60232 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSSCA1O60232 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSSCA1O60232 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSSCA1O60232 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSSCA1O60232 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSSCA1O60232 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SSSCA1O60232 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSSCA1O60232 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSSCA1O60232 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSSCA1O60232 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSSCA1O60232 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSSCA1O60232 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSSCA1O60232 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSSCA1O60232 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSSCA1O60232 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSSCA1O60232 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SSSCA1O60232 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms