Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGR1O43759 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGR1O43759 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYNGR1O43759 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGR1O43759 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGR1O43759 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGR1O43759 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGR1O43759 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGR1O43759 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGR1O43759 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGR1O43759 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGR1O43759 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGR1O43759 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGR1O43759 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGR1O43759 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGR1O43759 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGR1O43759 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGR1O43759 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGR1O43759 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGR1O43759 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGR1O43759 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGR1O43759 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGR1O43759 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGR1O43759 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGR1O43759 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGR1O43759 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGR1O43759 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGR1O43759 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGR1O43759 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGR1O43759 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGR1O43759 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGR1O43759 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR1O43759 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR1O43759 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR1O43759 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR1O43759 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR1O43759 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGR1O43759 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGR1O43759 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNGR1O43759 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNGR1O43759 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR1O43759 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms