Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF13O43567 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF13O43567 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF13O43567 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF13O43567 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF13O43567 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF13O43567 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF13O43567 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF13O43567 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF13O43567 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF13O43567 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF13O43567 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF13O43567 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF13O43567 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF13O43567 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF13O43567 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF13O43567 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF13O43567 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF13O43567 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF13O43567 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF13O43567 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF13O43567 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF13O43567 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF13O43567 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF13O43567 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF13O43567 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF13O43567 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF13O43567 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF13O43567 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF13O43567 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF13O43567 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF13O43567 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF13O43567 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF13O43567 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF13O43567 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF13O43567 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF13O43567 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF13O43567 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF13O43567 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF13O43567 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF13O43567 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF13O43567 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF13O43567 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF13O43567 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF13O43567 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF13O43567 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF13O43567 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF13O43567 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF13O43567 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF13O43567 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF13O43567 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF13O43567 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF13O43567 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF13O43567 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF13O43567 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF13O43567 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF13O43567 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF13O43567 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF13O43567 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF13O43567 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF13O43567 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF13O43567 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF13O43567 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF13O43567 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF13O43567 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF13O43567 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF13O43567 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF13O43567 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF13O43567 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF13O43567 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF13O43567 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF13O43567 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF13O43567 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF13O43567 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF13O43567 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF13O43567 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF13O43567 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF13O43567 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF13O43567 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RNF13O43567 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RNF13O43567 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF13O43567 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF13O43567 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF13O43567 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF13O43567 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF13O43567 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF13O43567 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF13O43567 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF13O43567 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF13O43567 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF13O43567 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF13O43567 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF13O43567 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF13O43567 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF13O43567 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF13O43567 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF13O43567 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF13O43567 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF13O43567 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF13O43567 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms