Protein–RNA interactions for Protein: O15350

TP73, Tumor protein p73, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP73O15350 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TP73O15350 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TP73O15350 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TP73O15350 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TP73O15350 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TP73O15350 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TP73O15350 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TP73O15350 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TP73O15350 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TP73O15350 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TP73O15350 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TP73O15350 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TP73O15350 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TP73O15350 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TP73O15350 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TP73O15350 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TP73O15350 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TP73O15350 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TP73O15350 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TP73O15350 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TP73O15350 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TP73O15350 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TP73O15350 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TP73O15350 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TP73O15350 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TP73O15350 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TP73O15350 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TP73O15350 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TP73O15350 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TP73O15350 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TP73O15350 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TP73O15350 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TP73O15350 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TP73O15350 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TP73O15350 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TP73O15350 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TP73O15350 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TP73O15350 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TP73O15350 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TP73O15350 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TP73O15350 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TP73O15350 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TP73O15350 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TP73O15350 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TP73O15350 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TP73O15350 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TP73O15350 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TP73O15350 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TP73O15350 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TP73O15350 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TP73O15350 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TP73O15350 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TP73O15350 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TP73O15350 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TP73O15350 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TP73O15350 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TP73O15350 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TP73O15350 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TP73O15350 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TP73O15350 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TP73O15350 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TP73O15350 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TP73O15350 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TP73O15350 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TP73O15350 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TP73O15350 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TP73O15350 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TP73O15350 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TP73O15350 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TP73O15350 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TP73O15350 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TP73O15350 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TP73O15350 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TP73O15350 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TP73O15350 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TP73O15350 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TP73O15350 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TP73O15350 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TP73O15350 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TP73O15350 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TP73O15350 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TP73O15350 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TP73O15350 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TP73O15350 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TP73O15350 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TP73O15350 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TP73O15350 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TP73O15350 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TP73O15350 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TP73O15350 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TP73O15350 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TP73O15350 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TP73O15350 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TP73O15350 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TP73O15350 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TP73O15350 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TP73O15350 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TP73O15350 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TP73O15350 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TP73O15350 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms