Protein–RNA interactions for Protein: O15321

TM9SF1, Transmembrane 9 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF1O15321 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TM9SF1O15321 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TM9SF1O15321 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TM9SF1O15321 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TM9SF1O15321 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TM9SF1O15321 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TM9SF1O15321 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TM9SF1O15321 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TM9SF1O15321 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TM9SF1O15321 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TM9SF1O15321 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TM9SF1O15321 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM9SF1O15321 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TM9SF1O15321 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM9SF1O15321 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM9SF1O15321 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM9SF1O15321 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM9SF1O15321 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM9SF1O15321 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM9SF1O15321 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM9SF1O15321 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM9SF1O15321 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM9SF1O15321 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM9SF1O15321 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TM9SF1O15321 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM9SF1O15321 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM9SF1O15321 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TM9SF1O15321 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM9SF1O15321 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM9SF1O15321 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM9SF1O15321 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM9SF1O15321 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM9SF1O15321 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM9SF1O15321 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TM9SF1O15321 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TM9SF1O15321 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TM9SF1O15321 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TM9SF1O15321 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TM9SF1O15321 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TM9SF1O15321 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TM9SF1O15321 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TM9SF1O15321 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TM9SF1O15321 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TM9SF1O15321 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TM9SF1O15321 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TM9SF1O15321 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TM9SF1O15321 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TM9SF1O15321 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TM9SF1O15321 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TM9SF1O15321 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TM9SF1O15321 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TM9SF1O15321 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TM9SF1O15321 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TM9SF1O15321 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM9SF1O15321 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM9SF1O15321 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM9SF1O15321 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TM9SF1O15321 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM9SF1O15321 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM9SF1O15321 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM9SF1O15321 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TM9SF1O15321 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM9SF1O15321 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM9SF1O15321 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM9SF1O15321 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM9SF1O15321 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM9SF1O15321 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms