Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC7O00311 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC7O00311 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC7O00311 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC7O00311 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC7O00311 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC7O00311 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC7O00311 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC7O00311 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC7O00311 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC7O00311 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC7O00311 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC7O00311 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC7O00311 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC7O00311 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC7O00311 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC7O00311 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC7O00311 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC7O00311 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC7O00311 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC7O00311 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC7O00311 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC7O00311 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC7O00311 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC7O00311 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC7O00311 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC7O00311 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC7O00311 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC7O00311 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC7O00311 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC7O00311 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC7O00311 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC7O00311 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC7O00311 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC7O00311 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC7O00311 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC7O00311 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC7O00311 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC7O00311 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC7O00311 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC7O00311 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC7O00311 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC7O00311 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC7O00311 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC7O00311 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC7O00311 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC7O00311 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC7O00311 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC7O00311 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC7O00311 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC7O00311 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC7O00311 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC7O00311 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC7O00311 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC7O00311 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDC7O00311 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDC7O00311 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC7O00311 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC7O00311 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC7O00311 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC7O00311 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC7O00311 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC7O00311 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC7O00311 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC7O00311 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDC7O00311 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC7O00311 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC7O00311 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC7O00311 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC7O00311 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC7O00311 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC7O00311 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC7O00311 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC7O00311 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC7O00311 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC7O00311 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC7O00311 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC7O00311 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC7O00311 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC7O00311 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC7O00311 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC7O00311 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC7O00311 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC7O00311 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC7O00311 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC7O00311 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC7O00311 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC7O00311 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC7O00311 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC7O00311 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC7O00311 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC7O00311 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC7O00311 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC7O00311 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC7O00311 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC7O00311 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC7O00311 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC7O00311 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDC7O00311 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC7O00311 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms