Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBXN8O00124 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBXN8O00124 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBXN8O00124 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN8O00124 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN8O00124 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN8O00124 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN8O00124 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN8O00124 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN8O00124 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN8O00124 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN8O00124 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN8O00124 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBXN8O00124 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBXN8O00124 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBXN8O00124 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBXN8O00124 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBXN8O00124 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBXN8O00124 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN8O00124 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN8O00124 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN8O00124 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN8O00124 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBXN8O00124 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN8O00124 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN8O00124 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN8O00124 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN8O00124 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN8O00124 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN8O00124 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN8O00124 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN8O00124 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN8O00124 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN8O00124 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN8O00124 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN8O00124 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN8O00124 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN8O00124 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN8O00124 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN8O00124 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN8O00124 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN8O00124 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN8O00124 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN8O00124 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN8O00124 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN8O00124 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN8O00124 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN8O00124 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN8O00124 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN8O00124 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN8O00124 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN8O00124 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN8O00124 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN8O00124 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN8O00124 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN8O00124 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN8O00124 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN8O00124 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN8O00124 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN8O00124 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN8O00124 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN8O00124 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN8O00124 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN8O00124 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN8O00124 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN8O00124 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN8O00124 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN8O00124 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN8O00124 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN8O00124 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN8O00124 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN8O00124 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN8O00124 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN8O00124 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN8O00124 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN8O00124 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBXN8O00124 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN8O00124 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN8O00124 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN8O00124 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN8O00124 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN8O00124 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN8O00124 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN8O00124 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN8O00124 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN8O00124 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN8O00124 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN8O00124 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN8O00124 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN8O00124 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN8O00124 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN8O00124 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN8O00124 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN8O00124 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN8O00124 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN8O00124 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN8O00124 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN8O00124 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN8O00124 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN8O00124 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms