Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCER2I3L3R5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCER2I3L3R5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCER2I3L3R5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CCER2I3L3R5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCER2I3L3R5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCER2I3L3R5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
CCER2I3L3R5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CCER2I3L3R5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CCER2I3L3R5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CCER2I3L3R5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCER2I3L3R5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
CCER2I3L3R5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCER2I3L3R5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCER2I3L3R5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCER2I3L3R5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CCER2I3L3R5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CCER2I3L3R5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CCER2I3L3R5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCER2I3L3R5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCER2I3L3R5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCER2I3L3R5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCER2I3L3R5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCER2I3L3R5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCER2I3L3R5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CCER2I3L3R5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CCER2I3L3R5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCER2I3L3R5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCER2I3L3R5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCER2I3L3R5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCER2I3L3R5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCER2I3L3R5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCER2I3L3R5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCER2I3L3R5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCER2I3L3R5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCER2I3L3R5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCER2I3L3R5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCER2I3L3R5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CCER2I3L3R5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CCER2I3L3R5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCER2I3L3R5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCER2I3L3R5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCER2I3L3R5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCER2I3L3R5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCER2I3L3R5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCER2I3L3R5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CCER2I3L3R5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CCER2I3L3R5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCER2I3L3R5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCER2I3L3R5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCER2I3L3R5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCER2I3L3R5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCER2I3L3R5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCER2I3L3R5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCER2I3L3R5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCER2I3L3R5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCER2I3L3R5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCER2I3L3R5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCER2I3L3R5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCER2I3L3R5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCER2I3L3R5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCER2I3L3R5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCER2I3L3R5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CCER2I3L3R5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCER2I3L3R5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCER2I3L3R5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CCER2I3L3R5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCER2I3L3R5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCER2I3L3R5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCER2I3L3R5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCER2I3L3R5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCER2I3L3R5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCER2I3L3R5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCER2I3L3R5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCER2I3L3R5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CCER2I3L3R5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCER2I3L3R5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCER2I3L3R5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCER2I3L3R5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCER2I3L3R5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCER2I3L3R5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCER2I3L3R5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CCER2I3L3R5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCER2I3L3R5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCER2I3L3R5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCER2I3L3R5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCER2I3L3R5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCER2I3L3R5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCER2I3L3R5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCER2I3L3R5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCER2I3L3R5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCER2I3L3R5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CCER2I3L3R5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CCER2I3L3R5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CCER2I3L3R5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCER2I3L3R5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCER2I3L3R5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCER2I3L3R5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CCER2I3L3R5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CCER2I3L3R5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms