Protein–RNA interactions for Protein: E7ERA6

RNF223, RING finger protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF223E7ERA6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF223E7ERA6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF223E7ERA6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF223E7ERA6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF223E7ERA6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF223E7ERA6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF223E7ERA6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF223E7ERA6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF223E7ERA6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF223E7ERA6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF223E7ERA6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF223E7ERA6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF223E7ERA6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF223E7ERA6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF223E7ERA6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF223E7ERA6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF223E7ERA6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF223E7ERA6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF223E7ERA6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF223E7ERA6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF223E7ERA6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF223E7ERA6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF223E7ERA6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF223E7ERA6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF223E7ERA6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF223E7ERA6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF223E7ERA6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF223E7ERA6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF223E7ERA6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF223E7ERA6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF223E7ERA6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF223E7ERA6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF223E7ERA6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF223E7ERA6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF223E7ERA6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF223E7ERA6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF223E7ERA6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF223E7ERA6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF223E7ERA6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF223E7ERA6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF223E7ERA6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF223E7ERA6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF223E7ERA6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF223E7ERA6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF223E7ERA6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF223E7ERA6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF223E7ERA6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF223E7ERA6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF223E7ERA6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms