Protein–RNA interactions for Protein: B7U540

KCNJ18, Inward rectifier potassium channel 18, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ18B7U540 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KCNJ18B7U540 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCNJ18B7U540 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNJ18B7U540 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNJ18B7U540 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNJ18B7U540 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNJ18B7U540 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNJ18B7U540 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNJ18B7U540 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNJ18B7U540 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNJ18B7U540 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNJ18B7U540 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNJ18B7U540 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNJ18B7U540 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNJ18B7U540 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNJ18B7U540 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNJ18B7U540 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNJ18B7U540 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNJ18B7U540 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNJ18B7U540 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNJ18B7U540 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNJ18B7U540 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNJ18B7U540 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNJ18B7U540 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNJ18B7U540 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNJ18B7U540 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNJ18B7U540 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNJ18B7U540 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNJ18B7U540 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNJ18B7U540 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNJ18B7U540 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNJ18B7U540 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNJ18B7U540 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNJ18B7U540 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNJ18B7U540 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNJ18B7U540 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNJ18B7U540 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNJ18B7U540 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNJ18B7U540 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNJ18B7U540 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNJ18B7U540 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNJ18B7U540 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNJ18B7U540 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNJ18B7U540 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNJ18B7U540 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
KCNJ18B7U540 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNJ18B7U540 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNJ18B7U540 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNJ18B7U540 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNJ18B7U540 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNJ18B7U540 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNJ18B7U540 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNJ18B7U540 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNJ18B7U540 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNJ18B7U540 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNJ18B7U540 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNJ18B7U540 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNJ18B7U540 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNJ18B7U540 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNJ18B7U540 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNJ18B7U540 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNJ18B7U540 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNJ18B7U540 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNJ18B7U540 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
KCNJ18B7U540 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNJ18B7U540 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNJ18B7U540 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNJ18B7U540 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNJ18B7U540 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNJ18B7U540 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNJ18B7U540 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNJ18B7U540 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNJ18B7U540 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNJ18B7U540 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNJ18B7U540 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNJ18B7U540 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNJ18B7U540 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNJ18B7U540 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNJ18B7U540 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNJ18B7U540 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNJ18B7U540 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNJ18B7U540 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNJ18B7U540 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNJ18B7U540 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNJ18B7U540 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNJ18B7U540 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNJ18B7U540 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNJ18B7U540 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNJ18B7U540 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNJ18B7U540 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNJ18B7U540 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNJ18B7U540 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNJ18B7U540 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNJ18B7U540 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNJ18B7U540 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNJ18B7U540 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNJ18B7U540 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNJ18B7U540 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNJ18B7U540 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNJ18B7U540 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms