Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPBD1B2RD01 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBD1B2RD01 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPBD1B2RD01 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBD1B2RD01 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPBD1B2RD01 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBD1B2RD01 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPBD1B2RD01 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBD1B2RD01 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBD1B2RD01 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBD1B2RD01 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBD1B2RD01 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPBD1B2RD01 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBD1B2RD01 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBD1B2RD01 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBD1B2RD01 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPBD1B2RD01 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPBD1B2RD01 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPBD1B2RD01 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPBD1B2RD01 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPBD1B2RD01 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPBD1B2RD01 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBD1B2RD01 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBD1B2RD01 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBD1B2RD01 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBD1B2RD01 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBD1B2RD01 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBD1B2RD01 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBD1B2RD01 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBD1B2RD01 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBD1B2RD01 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBD1B2RD01 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBD1B2RD01 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBD1B2RD01 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBD1B2RD01 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBD1B2RD01 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CENPBD1B2RD01 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBD1B2RD01 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBD1B2RD01 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBD1B2RD01 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPBD1B2RD01 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPBD1B2RD01 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPBD1B2RD01 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPBD1B2RD01 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPBD1B2RD01 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPBD1B2RD01 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPBD1B2RD01 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPBD1B2RD01 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBD1B2RD01 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBD1B2RD01 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms