Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALM2-AKAP2B1ALY0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PALM2-AKAP2B1ALY0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALM2-AKAP2B1ALY0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALM2-AKAP2B1ALY0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PALM2-AKAP2B1ALY0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PALM2-AKAP2B1ALY0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PALM2-AKAP2B1ALY0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALM2-AKAP2B1ALY0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALM2-AKAP2B1ALY0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALM2-AKAP2B1ALY0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PALM2-AKAP2B1ALY0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PALM2-AKAP2B1ALY0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PALM2-AKAP2B1ALY0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PALM2-AKAP2B1ALY0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PALM2-AKAP2B1ALY0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms