Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF1

SAC3D1, SAC3 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAC3D1A6NKF1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SAC3D1A6NKF1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SAC3D1A6NKF1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAC3D1A6NKF1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SAC3D1A6NKF1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAC3D1A6NKF1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SAC3D1A6NKF1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAC3D1A6NKF1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAC3D1A6NKF1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAC3D1A6NKF1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAC3D1A6NKF1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAC3D1A6NKF1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAC3D1A6NKF1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAC3D1A6NKF1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAC3D1A6NKF1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SAC3D1A6NKF1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAC3D1A6NKF1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAC3D1A6NKF1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAC3D1A6NKF1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAC3D1A6NKF1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAC3D1A6NKF1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAC3D1A6NKF1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAC3D1A6NKF1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAC3D1A6NKF1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAC3D1A6NKF1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAC3D1A6NKF1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAC3D1A6NKF1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAC3D1A6NKF1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAC3D1A6NKF1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAC3D1A6NKF1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAC3D1A6NKF1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAC3D1A6NKF1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAC3D1A6NKF1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAC3D1A6NKF1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAC3D1A6NKF1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAC3D1A6NKF1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAC3D1A6NKF1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAC3D1A6NKF1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAC3D1A6NKF1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAC3D1A6NKF1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAC3D1A6NKF1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAC3D1A6NKF1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAC3D1A6NKF1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAC3D1A6NKF1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAC3D1A6NKF1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAC3D1A6NKF1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAC3D1A6NKF1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAC3D1A6NKF1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAC3D1A6NKF1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAC3D1A6NKF1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAC3D1A6NKF1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAC3D1A6NKF1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAC3D1A6NKF1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAC3D1A6NKF1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SAC3D1A6NKF1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAC3D1A6NKF1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAC3D1A6NKF1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAC3D1A6NKF1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAC3D1A6NKF1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAC3D1A6NKF1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAC3D1A6NKF1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAC3D1A6NKF1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAC3D1A6NKF1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAC3D1A6NKF1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAC3D1A6NKF1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAC3D1A6NKF1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAC3D1A6NKF1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAC3D1A6NKF1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAC3D1A6NKF1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAC3D1A6NKF1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAC3D1A6NKF1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAC3D1A6NKF1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAC3D1A6NKF1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAC3D1A6NKF1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAC3D1A6NKF1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAC3D1A6NKF1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAC3D1A6NKF1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAC3D1A6NKF1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAC3D1A6NKF1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
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