Protein–RNA interactions for Protein: A6NK97

SLC22A20, Solute carrier family 22 member 20, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A20A6NK97 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC22A20A6NK97 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC22A20A6NK97 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC22A20A6NK97 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC22A20A6NK97 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC22A20A6NK97 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC22A20A6NK97 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC22A20A6NK97 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC22A20A6NK97 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC22A20A6NK97 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC22A20A6NK97 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC22A20A6NK97 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC22A20A6NK97 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC22A20A6NK97 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A20A6NK97 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A20A6NK97 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A20A6NK97 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A20A6NK97 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A20A6NK97 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A20A6NK97 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A20A6NK97 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A20A6NK97 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A20A6NK97 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A20A6NK97 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC22A20A6NK97 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC22A20A6NK97 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC22A20A6NK97 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A20A6NK97 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A20A6NK97 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms