Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC154A6NI56 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC154A6NI56 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC154A6NI56 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC154A6NI56 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC154A6NI56 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC154A6NI56 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC154A6NI56 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC154A6NI56 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC154A6NI56 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC154A6NI56 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC154A6NI56 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC154A6NI56 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC154A6NI56 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC154A6NI56 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC154A6NI56 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC154A6NI56 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC154A6NI56 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC154A6NI56 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC154A6NI56 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC154A6NI56 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC154A6NI56 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC154A6NI56 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC154A6NI56 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC154A6NI56 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC154A6NI56 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC154A6NI56 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC154A6NI56 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC154A6NI56 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC154A6NI56 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC154A6NI56 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC154A6NI56 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC154A6NI56 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC154A6NI56 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC154A6NI56 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC154A6NI56 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC154A6NI56 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC154A6NI56 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC154A6NI56 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC154A6NI56 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC154A6NI56 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC154A6NI56 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC154A6NI56 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC154A6NI56 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC154A6NI56 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC154A6NI56 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC154A6NI56 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC154A6NI56 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC154A6NI56 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC154A6NI56 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC154A6NI56 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC154A6NI56 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC154A6NI56 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC154A6NI56 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC154A6NI56 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC154A6NI56 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC154A6NI56 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC154A6NI56 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC154A6NI56 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC154A6NI56 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC154A6NI56 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC154A6NI56 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC154A6NI56 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC154A6NI56 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC154A6NI56 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC154A6NI56 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC154A6NI56 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC154A6NI56 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC154A6NI56 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC154A6NI56 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC154A6NI56 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC154A6NI56 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC154A6NI56 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC154A6NI56 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC154A6NI56 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC154A6NI56 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC154A6NI56 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC154A6NI56 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC154A6NI56 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC154A6NI56 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC154A6NI56 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC154A6NI56 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms