Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EPOPA6NHQ4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EPOPA6NHQ4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EPOPA6NHQ4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
EPOPA6NHQ4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EPOPA6NHQ4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPOPA6NHQ4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPOPA6NHQ4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EPOPA6NHQ4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EPOPA6NHQ4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EPOPA6NHQ4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EPOPA6NHQ4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EPOPA6NHQ4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EPOPA6NHQ4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EPOPA6NHQ4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EPOPA6NHQ4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EPOPA6NHQ4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EPOPA6NHQ4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EPOPA6NHQ4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EPOPA6NHQ4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EPOPA6NHQ4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EPOPA6NHQ4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EPOPA6NHQ4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EPOPA6NHQ4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EPOPA6NHQ4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EPOPA6NHQ4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EPOPA6NHQ4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EPOPA6NHQ4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EPOPA6NHQ4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EPOPA6NHQ4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EPOPA6NHQ4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EPOPA6NHQ4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPOPA6NHQ4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPOPA6NHQ4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPOPA6NHQ4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPOPA6NHQ4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPOPA6NHQ4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EPOPA6NHQ4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EPOPA6NHQ4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EPOPA6NHQ4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EPOPA6NHQ4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EPOPA6NHQ4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EPOPA6NHQ4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EPOPA6NHQ4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EPOPA6NHQ4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EPOPA6NHQ4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EPOPA6NHQ4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EPOPA6NHQ4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EPOPA6NHQ4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EPOPA6NHQ4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EPOPA6NHQ4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EPOPA6NHQ4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EPOPA6NHQ4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EPOPA6NHQ4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EPOPA6NHQ4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EPOPA6NHQ4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EPOPA6NHQ4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EPOPA6NHQ4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EPOPA6NHQ4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EPOPA6NHQ4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EPOPA6NHQ4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EPOPA6NHQ4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EPOPA6NHQ4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EPOPA6NHQ4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EPOPA6NHQ4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EPOPA6NHQ4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EPOPA6NHQ4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EPOPA6NHQ4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EPOPA6NHQ4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
EPOPA6NHQ4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EPOPA6NHQ4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EPOPA6NHQ4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EPOPA6NHQ4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EPOPA6NHQ4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EPOPA6NHQ4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EPOPA6NHQ4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EPOPA6NHQ4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
EPOPA6NHQ4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EPOPA6NHQ4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms