Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PABPN1LA6NDY0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PABPN1LA6NDY0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PABPN1LA6NDY0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PABPN1LA6NDY0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PABPN1LA6NDY0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PABPN1LA6NDY0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PABPN1LA6NDY0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PABPN1LA6NDY0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PABPN1LA6NDY0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PABPN1LA6NDY0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PABPN1LA6NDY0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PABPN1LA6NDY0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PABPN1LA6NDY0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PABPN1LA6NDY0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PABPN1LA6NDY0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PABPN1LA6NDY0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PABPN1LA6NDY0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PABPN1LA6NDY0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PABPN1LA6NDY0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PABPN1LA6NDY0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PABPN1LA6NDY0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PABPN1LA6NDY0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PABPN1LA6NDY0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PABPN1LA6NDY0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PABPN1LA6NDY0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PABPN1LA6NDY0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PABPN1LA6NDY0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PABPN1LA6NDY0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PABPN1LA6NDY0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PABPN1LA6NDY0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PABPN1LA6NDY0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PABPN1LA6NDY0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PABPN1LA6NDY0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PABPN1LA6NDY0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PABPN1LA6NDY0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PABPN1LA6NDY0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PABPN1LA6NDY0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PABPN1LA6NDY0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PABPN1LA6NDY0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PABPN1LA6NDY0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PABPN1LA6NDY0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PABPN1LA6NDY0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PABPN1LA6NDY0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PABPN1LA6NDY0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PABPN1LA6NDY0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PABPN1LA6NDY0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PABPN1LA6NDY0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PABPN1LA6NDY0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PABPN1LA6NDY0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PABPN1LA6NDY0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PABPN1LA6NDY0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PABPN1LA6NDY0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PABPN1LA6NDY0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPN1LA6NDY0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPN1LA6NDY0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPN1LA6NDY0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPN1LA6NDY0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPN1LA6NDY0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPN1LA6NDY0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms