Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GMNCA6NCL1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GMNCA6NCL1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GMNCA6NCL1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GMNCA6NCL1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
GMNCA6NCL1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GMNCA6NCL1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GMNCA6NCL1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GMNCA6NCL1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GMNCA6NCL1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GMNCA6NCL1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GMNCA6NCL1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GMNCA6NCL1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GMNCA6NCL1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GMNCA6NCL1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GMNCA6NCL1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GMNCA6NCL1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GMNCA6NCL1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GMNCA6NCL1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GMNCA6NCL1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GMNCA6NCL1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GMNCA6NCL1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GMNCA6NCL1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GMNCA6NCL1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GMNCA6NCL1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GMNCA6NCL1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GMNCA6NCL1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GMNCA6NCL1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GMNCA6NCL1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GMNCA6NCL1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GMNCA6NCL1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GMNCA6NCL1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GMNCA6NCL1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GMNCA6NCL1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GMNCA6NCL1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GMNCA6NCL1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GMNCA6NCL1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GMNCA6NCL1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GMNCA6NCL1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GMNCA6NCL1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GMNCA6NCL1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GMNCA6NCL1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GMNCA6NCL1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GMNCA6NCL1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GMNCA6NCL1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GMNCA6NCL1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GMNCA6NCL1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GMNCA6NCL1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GMNCA6NCL1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GMNCA6NCL1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GMNCA6NCL1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GMNCA6NCL1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GMNCA6NCL1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GMNCA6NCL1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GMNCA6NCL1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GMNCA6NCL1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GMNCA6NCL1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GMNCA6NCL1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GMNCA6NCL1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GMNCA6NCL1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GMNCA6NCL1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GMNCA6NCL1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GMNCA6NCL1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GMNCA6NCL1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GMNCA6NCL1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GMNCA6NCL1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GMNCA6NCL1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GMNCA6NCL1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GMNCA6NCL1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GMNCA6NCL1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GMNCA6NCL1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GMNCA6NCL1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GMNCA6NCL1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GMNCA6NCL1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GMNCA6NCL1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GMNCA6NCL1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GMNCA6NCL1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GMNCA6NCL1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GMNCA6NCL1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GMNCA6NCL1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GMNCA6NCL1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GMNCA6NCL1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GMNCA6NCL1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GMNCA6NCL1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GMNCA6NCL1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GMNCA6NCL1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GMNCA6NCL1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GMNCA6NCL1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GMNCA6NCL1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GMNCA6NCL1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GMNCA6NCL1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GMNCA6NCL1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GMNCA6NCL1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GMNCA6NCL1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GMNCA6NCL1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GMNCA6NCL1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GMNCA6NCL1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GMNCA6NCL1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GMNCA6NCL1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GMNCA6NCL1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms