Protein–RNA interactions for Protein: A6H8Y1

BDP1, Transcription factor TFIIIB component B'' homolog, humanhuman

Predictions only

Length 2,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDP1A6H8Y1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BDP1A6H8Y1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BDP1A6H8Y1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BDP1A6H8Y1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BDP1A6H8Y1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BDP1A6H8Y1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BDP1A6H8Y1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
BDP1A6H8Y1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
BDP1A6H8Y1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BDP1A6H8Y1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BDP1A6H8Y1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BDP1A6H8Y1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BDP1A6H8Y1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BDP1A6H8Y1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BDP1A6H8Y1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BDP1A6H8Y1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BDP1A6H8Y1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BDP1A6H8Y1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BDP1A6H8Y1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BDP1A6H8Y1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BDP1A6H8Y1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BDP1A6H8Y1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BDP1A6H8Y1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
BDP1A6H8Y1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
BDP1A6H8Y1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BDP1A6H8Y1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BDP1A6H8Y1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BDP1A6H8Y1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BDP1A6H8Y1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BDP1A6H8Y1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BDP1A6H8Y1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BDP1A6H8Y1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BDP1A6H8Y1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BDP1A6H8Y1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BDP1A6H8Y1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BDP1A6H8Y1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BDP1A6H8Y1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BDP1A6H8Y1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
BDP1A6H8Y1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BDP1A6H8Y1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BDP1A6H8Y1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BDP1A6H8Y1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BDP1A6H8Y1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BDP1A6H8Y1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BDP1A6H8Y1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BDP1A6H8Y1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BDP1A6H8Y1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BDP1A6H8Y1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BDP1A6H8Y1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BDP1A6H8Y1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BDP1A6H8Y1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BDP1A6H8Y1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BDP1A6H8Y1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BDP1A6H8Y1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BDP1A6H8Y1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BDP1A6H8Y1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BDP1A6H8Y1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BDP1A6H8Y1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BDP1A6H8Y1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BDP1A6H8Y1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BDP1A6H8Y1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BDP1A6H8Y1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BDP1A6H8Y1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BDP1A6H8Y1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BDP1A6H8Y1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BDP1A6H8Y1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BDP1A6H8Y1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BDP1A6H8Y1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BDP1A6H8Y1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BDP1A6H8Y1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BDP1A6H8Y1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BDP1A6H8Y1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BDP1A6H8Y1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BDP1A6H8Y1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BDP1A6H8Y1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BDP1A6H8Y1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BDP1A6H8Y1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BDP1A6H8Y1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BDP1A6H8Y1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BDP1A6H8Y1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BDP1A6H8Y1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BDP1A6H8Y1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BDP1A6H8Y1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BDP1A6H8Y1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BDP1A6H8Y1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BDP1A6H8Y1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BDP1A6H8Y1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BDP1A6H8Y1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BDP1A6H8Y1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BDP1A6H8Y1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BDP1A6H8Y1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BDP1A6H8Y1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BDP1A6H8Y1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BDP1A6H8Y1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BDP1A6H8Y1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BDP1A6H8Y1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BDP1A6H8Y1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BDP1A6H8Y1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BDP1A6H8Y1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BDP1A6H8Y1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms