Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf170A2RU37 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf170A2RU37 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
C9orf170A2RU37 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf170A2RU37 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf170A2RU37 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf170A2RU37 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf170A2RU37 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf170A2RU37 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf170A2RU37 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf170A2RU37 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf170A2RU37 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf170A2RU37 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf170A2RU37 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf170A2RU37 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf170A2RU37 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C9orf170A2RU37 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf170A2RU37 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf170A2RU37 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf170A2RU37 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf170A2RU37 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf170A2RU37 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf170A2RU37 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf170A2RU37 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf170A2RU37 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf170A2RU37 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf170A2RU37 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf170A2RU37 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf170A2RU37 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf170A2RU37 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf170A2RU37 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf170A2RU37 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf170A2RU37 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf170A2RU37 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf170A2RU37 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf170A2RU37 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf170A2RU37 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf170A2RU37 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf170A2RU37 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf170A2RU37 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf170A2RU37 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf170A2RU37 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf170A2RU37 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf170A2RU37 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf170A2RU37 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf170A2RU37 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf170A2RU37 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf170A2RU37 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf170A2RU37 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf170A2RU37 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf170A2RU37 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf170A2RU37 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf170A2RU37 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf170A2RU37 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf170A2RU37 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf170A2RU37 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf170A2RU37 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf170A2RU37 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf170A2RU37 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf170A2RU37 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf170A2RU37 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf170A2RU37 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf170A2RU37 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf170A2RU37 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf170A2RU37 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf170A2RU37 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf170A2RU37 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf170A2RU37 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf170A2RU37 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf170A2RU37 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf170A2RU37 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf170A2RU37 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf170A2RU37 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf170A2RU37 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf170A2RU37 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf170A2RU37 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C9orf170A2RU37 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf170A2RU37 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf170A2RU37 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf170A2RU37 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf170A2RU37 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf170A2RU37 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf170A2RU37 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf170A2RU37 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf170A2RU37 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf170A2RU37 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf170A2RU37 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf170A2RU37 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C9orf170A2RU37 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C9orf170A2RU37 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms