Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQ72

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQ72 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1W2PQ72 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1W2PQ72 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1W2PQ72 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A1W2PQ72 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A1W2PQ72 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A1W2PQ72 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A1W2PQ72 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A1W2PQ72 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PQ72 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1W2PQ72 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1W2PQ72 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1W2PQ72 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1W2PQ72 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1W2PQ72 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A1W2PQ72 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A1W2PQ72 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1W2PQ72 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1W2PQ72 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1W2PQ72 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1W2PQ72 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1W2PQ72 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1W2PQ72 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1W2PQ72 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1W2PQ72 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PQ72 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PQ72 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PQ72 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PQ72 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PQ72 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PQ72 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1W2PQ72 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1W2PQ72 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1W2PQ72 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1W2PQ72 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1W2PQ72 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1W2PQ72 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1W2PQ72 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1W2PQ72 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1W2PQ72 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1W2PQ72 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1W2PQ72 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1W2PQ72 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1W2PQ72 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1W2PQ72 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1W2PQ72 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1W2PQ72 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1W2PQ72 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1W2PQ72 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1W2PQ72 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1W2PQ72 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1W2PQ72 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1W2PQ72 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1W2PQ72 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1W2PQ72 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PQ72 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PQ72 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PQ72 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PQ72 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PQ72 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PQ72 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PQ72 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PQ72 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PQ72 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A1W2PQ72 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PQ72 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PQ72 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PQ72 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PQ72 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PQ72 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PQ72 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms