Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYG2

TRBV6-6, T-cell receptor beta variable 6-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-6A0A0A6YYG2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV6-6A0A0A6YYG2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV6-6A0A0A6YYG2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV6-6A0A0A6YYG2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV6-6A0A0A6YYG2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV6-6A0A0A6YYG2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV6-6A0A0A6YYG2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV6-6A0A0A6YYG2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV6-6A0A0A6YYG2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV6-6A0A0A6YYG2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV6-6A0A0A6YYG2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV6-6A0A0A6YYG2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV6-6A0A0A6YYG2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV6-6A0A0A6YYG2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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