Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRBV5-3A0A0A0MS03 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRBV5-3A0A0A0MS03 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRBV5-3A0A0A0MS03 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRBV5-3A0A0A0MS03 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRBV5-3A0A0A0MS03 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRBV5-3A0A0A0MS03 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRBV5-3A0A0A0MS03 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBV5-3A0A0A0MS03 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBV5-3A0A0A0MS03 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRBV5-3A0A0A0MS03 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRBV5-3A0A0A0MS03 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRBV5-3A0A0A0MS03 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRBV5-3A0A0A0MS03 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRBV5-3A0A0A0MS03 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRBV5-3A0A0A0MS03 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRBV5-3A0A0A0MS03 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRBV5-3A0A0A0MS03 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRBV5-3A0A0A0MS03 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRBV5-3A0A0A0MS03 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRBV5-3A0A0A0MS03 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRBV5-3A0A0A0MS03 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRBV5-3A0A0A0MS03 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBV5-3A0A0A0MS03 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRBV5-3A0A0A0MS03 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRBV5-3A0A0A0MS03 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRBV5-3A0A0A0MS03 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBV5-3A0A0A0MS03 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBV5-3A0A0A0MS03 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBV5-3A0A0A0MS03 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRBV5-3A0A0A0MS03 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRBV5-3A0A0A0MS03 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRBV5-3A0A0A0MS03 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBV5-3A0A0A0MS03 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRBV5-3A0A0A0MS03 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRBV5-3A0A0A0MS03 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRBV5-3A0A0A0MS03 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRBV5-3A0A0A0MS03 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRBV5-3A0A0A0MS03 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRBV5-3A0A0A0MS03 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRBV5-3A0A0A0MS03 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRBV5-3A0A0A0MS03 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRBV5-3A0A0A0MS03 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRBV5-3A0A0A0MS03 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRBV5-3A0A0A0MS03 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRBV5-3A0A0A0MS03 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
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