Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUV0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUV0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A087WUV0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A087WUV0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A087WUV0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A087WUV0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A087WUV0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A087WUV0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A087WUV0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A087WUV0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A087WUV0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A087WUV0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A087WUV0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A087WUV0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A087WUV0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A087WUV0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A087WUV0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A087WUV0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A087WUV0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A087WUV0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
A0A087WUV0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087WUV0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087WUV0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087WUV0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087WUV0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
A0A087WUV0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A087WUV0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A087WUV0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A087WUV0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A087WUV0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A087WUV0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A087WUV0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A087WUV0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A087WUV0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A087WUV0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087WUV0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A087WUV0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A087WUV0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A087WUV0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A087WUV0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A087WUV0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A087WUV0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A087WUV0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A087WUV0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A087WUV0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A087WUV0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A087WUV0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A087WUV0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
A0A087WUV0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A087WUV0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A087WUV0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A087WUV0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A087WUV0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A087WUV0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A087WUV0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A087WUV0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A087WUV0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A087WUV0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A087WUV0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A087WUV0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A087WUV0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A087WUV0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A087WUV0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A087WUV0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A087WUV0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A087WUV0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A087WUV0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A087WUV0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A087WUV0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A087WUV0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A087WUV0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A087WUV0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A087WUV0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A087WUV0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A087WUV0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A087WUV0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A087WUV0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms