Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAV27A0A087WT01 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAV27A0A087WT01 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAV27A0A087WT01 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAV27A0A087WT01 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAV27A0A087WT01 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAV27A0A087WT01 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAV27A0A087WT01 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAV27A0A087WT01 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAV27A0A087WT01 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAV27A0A087WT01 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAV27A0A087WT01 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAV27A0A087WT01 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAV27A0A087WT01 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAV27A0A087WT01 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAV27A0A087WT01 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAV27A0A087WT01 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAV27A0A087WT01 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAV27A0A087WT01 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAV27A0A087WT01 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAV27A0A087WT01 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAV27A0A087WT01 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAV27A0A087WT01 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAV27A0A087WT01 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAV27A0A087WT01 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAV27A0A087WT01 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAV27A0A087WT01 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAV27A0A087WT01 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAV27A0A087WT01 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAV27A0A087WT01 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAV27A0A087WT01 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAV27A0A087WT01 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAV27A0A087WT01 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAV27A0A087WT01 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAV27A0A087WT01 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAV27A0A087WT01 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAV27A0A087WT01 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAV27A0A087WT01 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAV27A0A087WT01 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAV27A0A087WT01 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAV27A0A087WT01 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAV27A0A087WT01 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAV27A0A087WT01 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAV27A0A087WT01 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAV27A0A087WT01 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAV27A0A087WT01 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAV27A0A087WT01 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAV27A0A087WT01 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAV27A0A087WT01 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAV27A0A087WT01 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAV27A0A087WT01 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAV27A0A087WT01 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAV27A0A087WT01 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAV27A0A087WT01 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAV27A0A087WT01 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAV27A0A087WT01 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAV27A0A087WT01 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAV27A0A087WT01 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAV27A0A087WT01 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAV27A0A087WT01 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAV27A0A087WT01 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAV27A0A087WT01 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAV27A0A087WT01 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAV27A0A087WT01 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAV27A0A087WT01 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAV27A0A087WT01 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAV27A0A087WT01 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAV27A0A087WT01 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAV27A0A087WT01 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAV27A0A087WT01 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAV27A0A087WT01 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAV27A0A087WT01 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAV27A0A087WT01 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAV27A0A087WT01 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAV27A0A087WT01 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAV27A0A087WT01 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAV27A0A087WT01 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAV27A0A087WT01 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAV27A0A087WT01 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAV27A0A087WT01 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAV27A0A087WT01 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAV27A0A087WT01 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAV27A0A087WT01 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAV27A0A087WT01 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAV27A0A087WT01 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAV27A0A087WT01 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAV27A0A087WT01 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAV27A0A087WT01 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAV27A0A087WT01 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAV27A0A087WT01 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAV27A0A087WT01 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAV27A0A087WT01 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAV27A0A087WT01 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAV27A0A087WT01 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAV27A0A087WT01 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAV27A0A087WT01 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAV27A0A087WT01 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms