Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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