Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
MAP3K4Q9Y6R4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MAP3K4Q9Y6R4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms