Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SNX8Q9Y5X2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX8Q9Y5X2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms