Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3D7

PAM16, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM16, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAM16Q9Y3D7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAM16Q9Y3D7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAM16Q9Y3D7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms