Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC49.29■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC49.29■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC49.29■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC49.29■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC49.29■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC49.28■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC49.28■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.28■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.28■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.28■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC49.28■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.28■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC49.27■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.27■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.27■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.27■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC49.27■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC49.27■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.27■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.27■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
NISCHQ9Y2I1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC49.25■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC49.25■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC49.24■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC49.24■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.24■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.24■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC49.24■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC49.24■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC49.24■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC49.23■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.23■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.22■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.21■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.21■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.21■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC49.21■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC49.21■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.21■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.21■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.21■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC49.21■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC49.21■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC49.2■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.2■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC49.19■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC49.19■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.47
NISCHQ9Y2I1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.19■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC49.18■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC49.18■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC49.17■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC49.17■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC49.17■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC49.17■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC49.16■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC49.16■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.16■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC49.16■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
NISCHQ9Y2I1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.15■■■■■ 5.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms