Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHOC2Q9UQ13 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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