Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPN11Q9UMQ6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN11Q9UMQ6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms