Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP2Q9ULQ0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms