Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ZNF608Q9ULD9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms