Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIH9

KLF15, Krueppel-like factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF15Q9UIH9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
KLF15Q9UIH9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLF15Q9UIH9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms