Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms