Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS7AQ9UBW8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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