Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG4Q9UBN1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms