Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SAE1Q9UBE0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAE1Q9UBE0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms