Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC88CQ9P219 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms