Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZDHHC3Q9NYG2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZDHHC3Q9NYG2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZDHHC3Q9NYG2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZDHHC3Q9NYG2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZDHHC3Q9NYG2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZDHHC3Q9NYG2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZDHHC3Q9NYG2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZDHHC3Q9NYG2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZDHHC3Q9NYG2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZDHHC3Q9NYG2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZDHHC3Q9NYG2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZDHHC3Q9NYG2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZDHHC3Q9NYG2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZDHHC3Q9NYG2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZDHHC3Q9NYG2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZDHHC3Q9NYG2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms