Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms