Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM260Q9NX78 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms