Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3EQ9NVU0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3EQ9NVU0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms