Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD7

RXFP3, Relaxin-3 receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXFP3Q9NSD7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RXFP3Q9NSD7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RXFP3Q9NSD7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RXFP3Q9NSD7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RXFP3Q9NSD7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RXFP3Q9NSD7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RXFP3Q9NSD7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RXFP3Q9NSD7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RXFP3Q9NSD7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RXFP3Q9NSD7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RXFP3Q9NSD7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RXFP3Q9NSD7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RXFP3Q9NSD7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RXFP3Q9NSD7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms