Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERINC1Q9NRX5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERINC1Q9NRX5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERINC1Q9NRX5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERINC1Q9NRX5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SERINC1Q9NRX5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms