Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA4L2Q9NRX3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA4L2Q9NRX3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA4L2Q9NRX3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA4L2Q9NRX3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA4L2Q9NRX3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA4L2Q9NRX3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA4L2Q9NRX3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA4L2Q9NRX3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA4L2Q9NRX3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA4L2Q9NRX3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA4L2Q9NRX3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA4L2Q9NRX3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFA4L2Q9NRX3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFA4L2Q9NRX3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms